بانک جزوات و مقالات تخصصی و کاربردی ترجمه ® ویژه دروس پزشکی ®

باکتری ها میکروارگانیسم های پروکاریوتی و تک سلولی هستند که فاقد رنگدانه های کلروفیل هستند. ساختار سلولی ساده تر از سایر موجودات است زیرا هیچ اندامک متصل به هسته یا غشاء وجود ندارد.

به دلیل وجود دیواره سلولی سفت و سخت، باکتری ها شکل مشخصی را حفظ می کنند، اگرچه از نظر شکل، اندازه و ساختار متفاوت هستند

هنگامی که زیر میکروسکوپ نوری مشاهده می شود، بیشتر باکتری ها به سه شکل اصلی ظاهر می شوند: میله ای (باسیلوس)، کره ای (کوکوس) و نوع مارپیچی (ویبریو). در واقع ساختار باکتری ها دارای دو جنبه آرایش و شکل است. تا آنجا که به ترتیب مربوط می شود، ممکن است خوشه های جفتی (diplo)، خوشه های انگور مانند (staphylo) یا زنجیره ای (strepto) باشند. از نظر شکل ممکن است عمدتاً میله ها (باسیل ها)، گرد (کوکسی ها) و اسپیرال ها (مارپیچی) باشند

 

بیماریزایی توانایی ایجاد بیماری با غلبه بر دفاع میزبان است، در حالی که حدت درجه بیماری زایی است. برای ایجاد بیماری، بیشتر پاتوژن‌ها باید به میزبان دسترسی پیدا کنند، به بافت‌های میزبان بچسبند، به دفاع میزبان نفوذ کنند یا از آنها فرار کنند و به بافت‌های میزبان آسیب برسانند. با این حال، برخی از میکروب ها با آسیب مستقیم به بافت میزبان باعث بیماری نمی شوند. در عوض، بیماری به دلیل تجمع مواد زائد میکروبی است. برخی از میکروب ها، مانند میکروب هایی که باعث پوسیدگی دندان و آکنه می شوند، می توانند بدون نفوذ به بدن باعث بیماری شوند. پاتوژن ها می توانند از طریق چندین راه به بدن انسان و سایر میزبان ها وارد شوند که به آنها دریچه های ورود می گویند ...

بخش های از فصل

بیماری به هر شرایطی گفته می شود که در آن ساختار یا عملکرد طبیعی بدن آسیب ببیند یا مختل شود.
صدمات یا ناتوانی‌های جسمی به عنوان بیماری طبقه‌بندی نمی‌شوند، اما می‌تواند دلایل مختلفی برای بیماری وجود داشته باشد، از جمله عفونت توسط یک پاتوژن، ژنتیک (مانند بسیاری از سرطان‌ها یا کمبودها)، علل محیطی غیرعفونی، یا پاسخ‌های ایمنی نامناسب. تمرکز ما در این فصل بر روی بیماری‌های عفونی خواهد بود، اگرچه هنگام تشخیص بیماری‌های عفونی، همیشه در نظر گرفتن علل غیرعفونی احتمالی مهم است.
علائم و نشانه های بیماری عفونت عبارت است از کلونیزاسیون موفق میزبان توسط یک میکروارگانیسم. عفونت‌ها می‌توانند منجر به بیماری شوند که باعث ایجاد علائم و نشانه‌هایی می‌شود که منجر به انحراف از ساختار یا عملکرد طبیعی میزبان می‌شود.
میکروارگانیسم هایی که می توانند باعث بیماری شوند به عنوان پاتوژن شناخته می شوند .....

پردازش اولیه نمونه های بالینی برای باکتری شناسی یک تلاش چند وجهی است که شامل تعدادی مراحل تصمیم گیری می شود، از جمله نیاز به پردازش نمونه برای باکتری شناسی بی هوازی، قارچ شناسی، ویروس شناسی و انگل شناسی، بسته به ماهیت نمونه (1). نیاز به آزمایش های مستقیم مانندرنگ آمیزی گرم نیز باید در نظر گرفته شود......

بخش های از فصل کتاب

اوتکولوژی چیست؟
اوتکولوژی به مطالعه برهمکنش موجودات با محیط اطرافشان می پردازد تا توزیع و فراوانی آنها را توضیح دهد. این با synecology متفاوت است زیرا ترجیح می دهد سازگاری گونه های خاص گیاهان و حیوانات را مطالعه کند

سینکولوژی چیست؟
سینکولوژی که به عنوان اکولوژی جامعه نیز شناخته می شود، مطالعه تعامل بین گونه ها با در نظر گرفتن عوامل زیادی مانند توزیع، فراوانی، ساختار، جمعیت شناسی و تعاملات موجود بین گونه ها است. این به مطالعه برهمکنش های یک جمعیت بر اساس ویژگی های فنوتیپی و ژنوتیپی آن می پردازد

Autecology در مقابل Synecology
Autecology مطالعه تعامل بین گونه های فردی با محیط خود است. Synecology مطالعه تعاملات بین دو یا چند گونه یا یک جمعیت با محیط خود است

وقتی کولیسین‌ها وارد سلول هدف می‌شوند، می‌توانند براساس مکانیزم‌های باکتریسیدال به سه دسته تقسیم شوند:

(‏۱)‏کولیسین‌های نوع Pore: تشکیل منافذ یا کانال‌ها در غشای داخلی باعث نشت ترکیبات سیتوپلاسمی، تخریب گرادیان الکتروشیمیایی، از دست دادن یون و مرگ سلول می‌شوند. این ترکیبات شامل کولیسین A، B، E۱، Ia، Ib، K و N؛

(‏۲)‏کولیسین‌های نوع نوکلئاز: کولیسین‌های حاوی DNase، ۱۶ S rRNase، و tRNase برای هضم غیر اختصاصی DNA و RNA باکتری. اینها شامل کولیسین E۲ تا E۹ هستند.

(‏۳)‏کولیسین های نوع پپتیدوگلیکاناز: این پروتئین‌ها می‌توانند پیش‌ساز پپتیدوگلیکان را هضم کنند، که منجر به ناتوانی در سنتز پپتیدوگلیکان و مرگ باکتری می‌شود. ​

میکروسین Microcins

میکروسین ها پپتیدهای ضد میکروبی آبگریز سنتز شده ریبوزومی با وزن مولکولی کم (‏۱۰ کیلو دالتون)‏هستند که توسط پروتئین کولیسین‌های با وزن مولکولی بالا ۲۵ - ۸۰ کیلو دالتون تشخیص داده می‌شوند. میکروسین ها به عنوان پپتیدهای اولیه تولید می‌شوند، از جمله پپتید رهبر N - ترمینال و پپتیدهای هسته. پپتیدهای پیش‌ساز میکروسین ممکن است در طی بلوغ به یک میکروسین فعال، تحت یک فرآیند اصلاح پس از ترجمه قرار گیرند یا نگیرند. میکروسین ها عمدتا توسط انتروباکتریاسه تولید می‌شوند که مقاومت زیادی نسبت به گرما، pH شدید و پروتئازها نشان می‌دهند. مکانیسم‌های باکتریسیدال میکروسین‌ها متنوع هستند، از جمله نوع تشکیل حفره، نوع نوکلئاز، مانند عملکردهای DNase و RNase، و بازدارنده‌های سنتز پروتئین یا تکثیر DNA. هیچ ژن میکروسین ژن لیز کننده مربوطه ندارد و میکروسین ها در خارج از باکتری‌ها از طریق سیستم ترشح انتقال‌دهنده نوع ۱ ABC (‏کاست متصل شونده به ATP)‏ترشح می‌شوند که از تعدادی پروتئین تشکیل شده‌است.​ ​

میکروسین ها براساس جرم مولکولی، پیوندهای دی سولفیدی در ساختار و تغییرات پس از ترجمه به دو دسته تقسیم می‌شوند. میکروسین‌های کلاس I، مانند میکروسین B۱۷، C۷ - C۵۱، D۹۳ و J۲۵ از پپتیدهای تغییر یافته پس از ترجمه با وزن مولکولی پایین (‏۵ کیلو دالتون)‏هستند. وزن مولکولی میکروسین‌های کلاس II بزرگ‌تر (‏۵ - ۱۰ کیلو دالتون)‏از وزن مولکولی میکروسین‌های کلاس I هستند. میکروسین‌های کلاس II را می‌توان به دو زیر کلاس، شامل کلاس IIa و IIb، تقسیم کرد. میکروسین های کلاس IIa، مانند میکروسین L، V و N به سه ژن مختلف برای سنتز و تجمع پپتیدهای کاربردی نیاز دارند. میکروسین‌های کلاس IIb، مانند میکروسین E۴۹۲، M و H۴۷، پپتیدهای خطی با یا بدون تغییرات پس از ترجمه در پایانه C هستند. ​

جدول ۲ | طرح طبقه‌بندی برای میکروسین‌های گرم منفی. ​

باکتریوسین های باکتری های گرم مثبت

بر خلاف کولیسین‌های باکتری‌های گرم منفی، که پروتئین‌های پلاسمید یا کروموزومی کد کننده ۲۵ - ۸۰ کیلو دالتون هستند، باکتریوسین های گرم مثبت خصوصیات مشابهی با میکروسین ها دارند. این باکتریوسین های کد شده توسط ژن، پپتیدهای ضد میکروبی با وزن مولکولی پایین با کم‌تر از ۶۰ آمینو اسید هستند. در باکتری‌های گرم مثبت، باکتری‌های اسید لاکتیک، باکتری‌های معمول هستند که انواع مختلفی از باکتریوسین ها را در اندازه‌ها، ساختارها، خواص فیزیکوشیمیایی و طیف بازدارندگی مختلف تولید می‌کنند. به دلیل تنوع زیاد باکتریوسین ها، برخی از تحقیقات روش‌های مختلفی را برای طبقه‌بندی باکتریوسین ها از باکتری‌های گرم مثبت نشان می‌دهند. 

باکتریوسین های گرم مثبت معمولا به کلاس I (‏پپتیدهای تغییر یافته، لنتی‌بیوتیک‌ها)‏، کلاس II (‏پپتیدهای تغییر نیافته، غیر لنتی بیوتیک)‏و کلاس III (‏پروتئین‌های بزرگ، ناپایداری حرارتی)‏تقسیم می‌شوند. ​

پپتیدهای کلاس I باکتریوسین های تغییریافته پس از ترجمه یا لنتی‌بیوتیک‌های کم‌تر از ۲۸ آمینواسید پپتیدهای ممبرانوس کوچک (‏۵ کیلو دالتون)‏، پپتیدهای خطی یا کروی که شامل لنتیونین، متیل لنتیونین و آمینواسیدهای دهیدراته هستند. پپتیدهای ساختار خطی حالت اختلال در عملکرد غشا و پپتیدهای ساختار کروی با واکنش آنزیمی سلولی هستند. باکتریوسین های کلاس I بعدا به چند لنتی بیوتیک تقسیم می‌شوند، از جمله پپتید خطی نیسین و مرسازیدین پپتید کروی، لبیرینتوپپتین، مانند لبیرینتوپپتین A۲ پپتید کروی، و ساکتی بیوتیک ها، مانند سابتیلوزین A پپتید کروی. ​

باکتریوسین های کلاس دو، ۳۰ تا ۶۰ آمینو اسید (‏۱۰ کیلو دالتون)‏هستند، که همیشه ویژگی‌های منحصر به فرد تحمل گرما، بدون تغییر غیر لنتیونین و بار مثبت را نشان می‌دهند. باکتریوسین های کلاس II توسط کوتر و همکاران (‏۲۰۱۳)‏به پنج زیر کلاس تقسیم می‌شوند. .. باکتریوسین های کلاس IIa پپتیدهای فعال لیستریا با توالی آمینواسیدی مشترک YGNGVXaaC در N - ترمینال هستند و شامل پدیوسین PA - ۱ و کارنوباکتریوسین X هستند. باکتریوسین های کلاس IIb به دو پپتید تغییر نیافته مختلف برای تشکیل یک کمپلکس اتصالی کاملا فعال، مانند لاکتاسین F و ABP - ۱۱۸ نیاز دارند. باکتریوسین های نوع IIc باکتریوسین های پپتیدی حلقوی مانند کارنوسیکلین A و انتروسین AS - ۴۸ هستند. باکتریوسین های کلاس IID خطی، غیر پدیوسین، باکتریوسین های تک پپتیدی، از جمله اپیدرمیسین NI۰۱ و لاکتوکوکوسین A هستند. باکتریوسین های کلاس IIe، تغییرات پس از ترجمه غیر ریبوزومی در منطقه غنی از سرین انتهای کربوکسیل، مانند میکروسین E۴۹۲ هستند. از آنجا که میکروسین E۴۹۲ از کلبسیلا پنومونیه جدا شد، در حالی که باکتری گرم مثبت نبود، باکتریوسین های کلاس IIe باید به میکروسین های باکتری گرم منفی طبقه‌بندی شوند. ​

باکتریوسین های کلاس III وزن مولکولی بزرگ (‏kDa ۳۰)‏، پروتئین‌های ناپایدار گرمایی هستند. کلاس ۳ می‌تواند به دو گروه مجزا تقسیم شود. گروه A باکتریوسین ها آنزیم‌های باکتریولیتیک هستند که با لیز کردن سلول مانند انترولیزین A، سویه‌های حساس را از بین می‌برند. باکتریوسین های گروه ب، پروتئین‌های غیرلیتیکی مانند کازئی سین ۸۰ و هلوتیسین جی. ​

نایسریا گونوره تشخیص آزمایشگاهی، درمان، پیشگیری

Neisseria gonorrhoeae یک پاتوژن اجباری انسانی و عامل ایجاد کننده سوزاک است.
در ایالات متحده، این دومین بیماری مسری شایع است که سالانه بیش از 350000 مورد گزارش می شود.
سندرم ها شامل سرویکسیت در زنان و اورتریت، فارنژیت و پروکتیت در هر دو جنس است. در صورت عدم درمان، زنان ممکن است عواقب شدید بیماری التهابی لگن، درد مزمن لگن، حاملگی خارج از رحم و ناباروری لوله‌ها را تجربه کنند، در حالی که مردان ممکن است به اپیدیدیمیت، پروستاتیت و تنگی مجرای ادرار مبتلا شوند

انتخاب و جمع آوری نمونه
انتخاب و روش جمع‌آوری نمونه به روش آزمایشی مورد استفاده در آزمایشگاه و سن، جنس و گرایش جنسی بیمار بستگی دارد.

مجرای ادرار: هنگامی که بیماران ترشح دارند ترشحات مجرای ادرار را نشان می دهند. اگر ترشحی وجود نداشت، مجرا را به صورت عمودی فشرده کنید تا مجرای ادرار دیستال باز شود و یک سواب نازک و مرطوب شده با آب (کلسیم آلژینات یا داکرون) با سیم انعطاف پذیر به آرامی (3 تا 4 سانتی متر در نرها یا 1 سانتی متر تا 2 سانتی متر در ماده ها) وارد کنید. ، به آرامی بچرخانید و به آرامی عقب بکشید.
ادرار: از بیماران بخواهید که فقط 10 تا 15 میلی لیتر اول ادرار را جمع آوری کنند. برای افزایش احتمال تشخیص ارگانیسم، بیماران نباید حداقل 2 ساعت قبل از جمع آوری نمونه ادرار خود را تخلیه کنند.
دهانه رحم: برای مشاهده دهانه رحم، اسپکولوم را در واژن قرار دهید. یک سواب به طول 1 تا 3 سانتی‌متر را در کانال آندو سرویکس قرار دهید و به مدت 10 تا 30 ثانیه بچرخانید تا اگزودا جذب شود.
واژینال: در صورت وجود ترشحات واژن جمع آوری کنید. نمونه های شستشوی واژن برای دختران قبل از بلوغ ارجح و قابل قبول است. در صورت عدم امکان، یک سواب پنبه ای استریل را به دیواره خلفی واژن بمالید و اجازه دهید سواب نمونه را جذب کند.
رکتوم: نمونه ها را می توان blindly  یا ترجیحاً از طریق آنوسکوپ تهیه کرد. سواب 2 تا 3 سانتی متری را داخل کانال مقعد قرار دهید. اجتناب از مواد مدفوع، چرخش به کریپت های نمونه درست در داخل حلقه مقعد. اجازه دهید سواب به مدت 10 ثانیه نمونه را جذب کند

اوروفارنکس: سواب‌های استریل را روی حلق خلفی و کریپت‌های لوزه‌ها بمالید یا از نوزادان آسپیراسیون نازوفارنکس بگیرید.
ملتحمه: هر گونه اگزودا یا چرک موجود در چشم باید با دقت با سواب استریل خارج شود. برای مالش ملتحمه آسیب دیده باید از سواب دوم مرطوب شده با نمک استفاده شود. این سواب باید به یک ویال از محیط انتقال شکسته شود.
مایعات بدن استریل: محل سوراخ شدن پوست را با ید (1٪ تا 2٪ یا محلول 10٪ پوویدون ید [1٪ ید آزاد]) تمیز کنید. در صورت استفاده از تنتور ید، برای جلوگیری از سوختگی، آن را با اتانول 70 درصد حذف کنید. انجام آسپیراسیون از راه پوست برای مایعات جنب، پریکارد، صفاقی یا سینوویال. در صورت امکان از مجموعه غیر هپارینیزه استفاده کنید

حمل و نقل و جابجایی
برای به حداقل رساندن اثرات بازدارندگی مواد ناشناخته در نمونه، سواب ها باید مستقیماً روی محیط رشد تلقیح شوند یا بلافاصله پس از نمونه برداری در محیط انتقال سواب قرار گیرند.
اگر محیط تلقیح شده به آزمایشگاه محلی منتقل می شود، پلیت ها نباید بیش از 5 ساعت در یک فضای غنی شده با CO2 با استفاده از یک شیشه شمع یا یک سیستم تجاری تولید کننده CO2 در دمای اتاق نگهداری شوند.
در صورت نیاز به حمل و نقل در مسافت های طولانی، نمونه ها باید روی محیط های موجود در یک سیستم تولید کننده CO2 تلقیح شوند، به مدت 18 ساعت تا 24 ساعت انکوبه شوند و قبل از ارسال روی صفحه رشد قابل مشاهده داشته باشند

میکروسکوپ
اسمیر مستقیم برای رنگ آمیزی گرم ممکن است به محض جمع آوری نمونه سواب از مجرای ادرار، دهانه رحم، واژن یا رکتوم انجام شود.
رنگ آمیزی گرم اسمیر از اگزوداهای مجرای ادرار یا ترشحات اندوسرویکال، دیپلوکوک های درون سلولی گرم منفی، غیر متحرک و معمولی را نشان می دهد

کشت 
روش آزمایشگاهی ترجیحی فعلی برای تشخیص عفونت N. gonorrhoeae جداسازی و شناسایی عامل است.
نمونه های اولیه باید روی آگار شکلاتی غیرانتخابی و آگار انتخابی حاوی عوامل ضد میکروبی که مانع رشد باکتری ها و قارچ های کامنسال می شوند تلقیح شوند.

محیط رشد:

اصلاح شده Thayer Martin Medium (آگار شکلاتی حاوی آنتی بیوتیک ها (وانکومایسین، کولیستین، تری متوپریم و نیستاتین)) اغلب مورد استفاده قرار می گیرد.
محیط اصلاح شده نیویورک سیتی (MNC) نیز برای کشت نایسریا گونوره استفاده می شود.
پلیت های تلقیح شده باید در دمای 35 تا 37 درجه سانتیگراد در یک جو مرطوب غنی شده با CO2 (3 تا 7 درصد) انکوبه شوند.
برای آزمایشات اضافی باید از کشت 18 تا 24 ساعته به عنوان تلقیح استفاده شود.
توجه: پلیت ها نباید بیش از 48 ساعت انکوبه شوند زیرا بیشتر کشت های قدیمی در شرایط نگهداری دوام نمی آورند. اتولیز ممکن است در طی انکوباسیون طولانی مدت اتفاق بیفتد 

جدایه ها باید حداقل یک بار در محیط غیرانتخابی پس از جداسازی اولیه قبل از استفاده در یک آزمایش تشخیصی که به کشت خالص یا تلقیح سنگین نیاز دارد، زیر کشت قرار گیرند.
شناسایی احتمالی:

شناسایی احتمالی N. gonorrhoeae بر روی جداسازی یک دیپلوکوک گرم منفی اکسیداز مثبت، کاتالاز مثبت استوار است که از محل های تناسلی ادراری که در محیط‌های انتخابی رشد می‌کنند، بازیابی شده است

 تست های تاییدی
تست های تاییدی شامل تست های بیوشیمیایی، تست های سوبسترای آنزیمی کروموژنیک، تست های ایمنی و روش های اسید نوکلئیک می باشد.
واکنش های بیوشیمیایی:

تست اکسیداز: مثبت
گلوکز را تخمیر می کند اما مالتوز، ساکارز یا لاکتوز را تخمیر نمی کند
تست DNase: منفی
آزمایش بتا گالاکتوزیداز (ONPG): منفی است
تست گلوتامیل آمینوپپتیداز (GAP): منفی
آزمایش سوبسترای آنزیمی:

هیدروکسی پرولی‌آمینوپپتیداز مثبت

تست حساسیت ضد میکروبی
نظارت بر حساسیت های ضد میکروبی N. gonorrhoeae برای بررسی شکست درمان و ارزیابی اثربخشی درمان های توصیه شده در حال حاضر مهم است.
مقاومت آنتی بیوتیکی در نایسریا گونوره به شدت درمان موفق سوزاک را به خطر انداخته است.
پنی سیلین ها، تتراسایکلین ها و ماکرولیدهای جدیدتر کاربرد محدودی دارند و اسپکتینومایسین (و در بسیاری از نقاط جهان کینولون ها) به دلیل مقاومت حذف شده اند.
از درمان‌های معمولاً توصیه‌شده، فقط سفالوسپورین‌های نسل سوم و به‌ویژه سفتریاکسون اثربخشی خود را حفظ کرده‌اند، اما حساسیت به این آنتی‌بیوتیک‌ها نیز کاهش یافته است

درمان
درمان فعلی توصیه شده توسط CDC یک آنتی بیوتیک درمانی دوگانه است.
این شامل یک دوز تک تزریقی سفتریاکسون (یک سفالوسپورین نسل سوم) همراه با آزیترومایسین است که به صورت خوراکی تجویز می شود. آزیترومایسین برای پوشش اضافی سوزاک که ممکن است به سفالوسپورین مقاوم باشد اما نسبت به ماکرولیدها حساس باشد ترجیح داده می شود.
شرکای جنسی (که توسط CDC به عنوان تماس جنسی در 60 روز گذشته تعریف شده است) نیز باید مطلع شوند، آزمایش شوند و تحت درمان قرار گیرند.
مهم است که اگر علائم پس از دریافت درمان عفونت N. gonorrhoeae ادامه یابد، باید یک ارزیابی مجدد انجام شود

پیشگیری از عفونت
انتقال را می توان با استفاده از موانع لاتکس (مانند کاندوم یا سدهای دندانی dental dams) در طول رابطه جنسی و با محدود کردن شرکای جنسی کاهش داد.
در هنگام رابطه جنسی دهانی و مقعدی نیز باید از کاندوم و dental dams استفاده شود.
پرهیز از رابطه جنسی
داشتن یک شریک جنسی تک همسر که به این عفونت مبتلا نیست
برای به حداقل رساندن خطر انتقال سوزاک به دیگران، حداقل تا هفت روز پس از اتمام درمان از داشتن رابطه جنسی خودداری کنید

سد های دندانی ورقه های لاتکس یا پلی اورتان هستند که بین دهان و واژن یا مقعد هنگام رابطه جنسی دهانی استفاده می شوند

باکتری های گرم مثبت هوازی بی هوازی اختیاری

باکتری های گرم منفی هوازی بی هوازی اختیاری

باکتری های بی هوازی

سایر باکتری های مهم

سایز باکتری ها در مقایسه با یک گلبول قرمز/ فتوگراف کوکسی گرم مثبت و باسیل گرم منفی

ساختار دیواره سلولی باکتری های گرم مثبت و گرم منفی

واحد های تکراری پپتیدوگلیکان شامل ان استیل گلوکز آمین و ان استیل مورامیک اسید